Вакансия: Middle-Биоинформатик (разработка NGS тест-систем) в Санкт-Петербург

Необходимые навыки

• > Linux
• > Python
• > Git
• > Docker
• > Bash

Требования

Опыт в сборке биоинформатических пайплайнов от 1 года. Высшее образование по одной из специальностей: биоинформатика, биология, математика, IT.

Обязанности

Разработка алгоритмов и инструментов анализа NGS данных (разработка новых и доработка существующих). Сборка и масштабирование пайплайнов. Разработка методов оценки качества...

Описание

Российский производитель тест-систем для высокопроизводительного секвенирования (NGS) ищет биоинформатика, для которого любовь к алгоритмам и фундаментальной биологии – это вещи неразделимые! Концепция продуктов компании — кастомизированный подход и решение конкретных прикладных задач от диагностики орфанных заболеваний до подбора таргетной терапии различных онкозаболеваний.

Коллектив: Группа биомедицинской аналитики находится на стыке молекулярной биологии и IT. В команду входят молекулярные биологи, генетики, математики и программисты. Это позволяет на глубоком уровне понять клиническую задачу и найти оптимальный способ обработки данных в каждом конкретном случае.

Чем предстоит заниматься:

• Разработка алгоритмов и инструментов анализа NGS данных (разработка новых и доработка существующих);
• Сборка и масштабирование пайплайнов;
• Разработка методов оценки качества данных, отражающих особенности лабораторных этапов;
• Аналитическая и клиническая валидация лабораторных протоколов и связанных с ними методов анализа данных.

Ожидаем от кандидата:

• Опыт в сборке биоинформатических пайплайнов от 1 года;
• Высшее образование по одной из специальностей: биоинформатика, биология, математика, IT.
• Знание современных биоинформатических подходов и программных пакетов, готовность осваивать новые в разумные сроки;
• Умение аргументировано донести свою мысль.

Будет преимуществом:

• Знание Docker;
• Знание одного из инструментов сборки пайплайнов: Snakemake, CWL, NextFlow.

Условия:

• Достойная заработная плата, определяется по результатам собеседования;
• Официальное оформление по ТК РФ;
• Гибридный/дистанционный формат работы;
• Энергичный коллектив людей, которые занимаются скалолазанием, ходят в походы, катаются на лыжах и даже приезжают на работу на велосипеде;
• Для тех, кто любит работать в офисе: обеды за счет компании и чай/кофе в офисе.

Для отклика: Напишите, пожалуйста, в сопроводительном письме, с какими NGS данными Вы работали, какие инструменты использовали.